La Universidad Pompeu Fabra es la única universidad del estado español que aparece en el ranking Nature Index 2017 de Innovación, una clasificación que mide la influencia de la investigación de una institución sobre les patentes que realizan terceros. En concreto, el ranking contabiliza las citas de los artículos de una institución que aparecen en patentes desarrolladas por otras instituciones.

Bajo este parámetro (Normalized Lens Influence Metric), la UPF se sitúa en la posición 67 de Europa y 178 del mundo, dentro de los doscientos centros recogidos. El Centro Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), la otra institución del Estado que aparece en la lista, a parte de la UPF, lo hace en el puesto 176. El ranking se compone sobre todo de universidades estadounidenses, encabezadas por el Scripps Research Institute (TSRI), la Universidad Rockefeller y el Massachusetts Institute of Technology (MIT).

Además de este parámetro, el ranking incluye dos indicadores que hacen referencia a los artículos del periodo 2012-2016: el Article Count (AC), el recuento de artículos recogidos en Nature Index en los que consta, como mínimo, un investigador de la institución; y el Weighted Fractional Count (WFC), el recuento fraccionado ponderado para los mismos.

La lista se completa con los artículos sobre ciencias naturales de una institución recogidos en InCites (herramienta que forma parte de Web of Science, que evidencia la producción científica basada en citas) y el porcentaje de todos los artículos sobre ciencias naturales de la institución que constan en Nature Index.

Entre todos ellos, la UPF destaca en este último indicador, con un 11,8% de los artículos publicados por investigadores de la Universidad en el ámbito de las ciencias naturales que están incluidos en Nature Index. En cuanto al resto, cuenta con 333 artículos en el AC, 73,9 en el WFC, y suma 2.834 artículos de ciencias naturales incluidos en InCites.

El ranking bibliométrico Nature Index, que se empezó a publicar en 2013, es una base de datos de información de filiación de autores recopilada a partir de artículos de investigación publicados en una selección de 68 revistas científicas de alta calidad pertenecientes a los campos de la química, las ciencias de la tierra y el medio ambiente, las ciencias de la vida y las ciencias físicas. A pesar de que estas revistas representan menos del 1% de las publicaciones indexadas en la base de datos de Web of Science (Thomson Reuters), acumulan el 30% de las citas globales en cuanto al ámbito de las ciencias naturales.