Josep Fontana fou un apassionat dels llibres i, al llarg de la seva vida, va aplegar una gran i magnífica biblioteca.

En la seva col·lecció no només hi destaquen els llibres d’història, sinó també d’economia, de literatura, de filosofia i de molts altres temes.

Josep Fontana va voler llegar els més de 37.000 documents que formaven part de la seva biblioteca a la Universitat Pompeu Fabra i que es conserven a la Biblioteca de l'Institut d'Història Jaume Vicens Vives.