João Vicente Melo empezó su investigación académica independiente en 2006, trabajando en una tesis para su grado en sociología. En 2007 trabajó como asistente de investigación en el CIES, IUL (Centro para la investigación y estudios en sociología, Instituto Universitario de Lisboa) como miembro del equipo evaluador del Portuguese National Reading Plan (PNL). En 2008 continuó sus estudios en Goldsmiths, Universidad de Londres y trabajó en su tesis de maestría en historia cultural. En 2012 se doctoró en la Universidad de Swansea con una tesis doctoral sobre los rituales diplomáticos y los  contactos del Estado portugués da Índia en la primera mitad del siglo XVIII. Actualmente trabaja con el profesor Joan-Pau Rubiés en las representaciones del Imperio Mughal que los misioneros jesuitas proyectaron entre 1580 y 1773. Asimismo trabaja en un libro basado en un estudio comparativo de las prácticas rituales en la India portuguesa y Brasil durante el siglo XVIII. En los últimos tres años ha publicado sus investigaciones en libros colectivos y revistas arbitradas y reconocidas internacionalmente como el Journal of the Economic and Social History of the Orient and Portuguese Studies.