Publications
2024 (2)Fiore L, Arderiu J, Martí-Sarrias A, Turpín I, Pareja RI, Navarro A, Holubiec M, Bianchelli J, Falzone T, Spelzini G, Scicolone G, Acosta S. Early Unguided Human Brain Organoid Neurovascular Niche Modeling into the Permissive Chick Embryo Chorioallantoic Membrane. Journal of Visualized Experiments 2024; 2024(204). |
|
Fromont LA, Moldes M, Baudis M, Brookes AJ, Navarro A, Rambla J. Twelve quick tips for deploying a Beacon. PLoS Computational Biology 2024; 20(3). |
2023 (14)Barteri F, Valenzuela A, Farré X, de Juan D, Muntané G, Esteve-Altava B, Navarro A. CAAStools: a toolbox to identify and test Convergent Amino Acid Substitutions. Bioinformatics 2023; 39(10). |
|
Gao H.; Hamp T.; Ede J.; Schraiber J.G.; McRae J.; Singer-Berk M.; Yang Y.; Dietrich A.S.D.; Fiziev P.P.; Kuderna L.F.K.; Sundaram L.; Wu Y.; Adhikari A.; Field Y.; Chen C.; Batzoglou S.; Aguet F.; Lemire G.; Reimers R.; Balick D.; Janiak M.C.; Kuhlwilm M.; Orkin J.D.; Manu S.; Valenzuela A.; Bergman J.; Rousselle M.; Silva F.E.; Agueda L.; Blanc J.; Gut M.; de Vries D.; Goodhead I.; Harris R.A.; Raveendran M.; Jensen A.; Chuma I.S.; Horvath J.E.; Hvilsom C.; Juan D.; Frandsen P.; de Melo F.R.; Bertuol F.; Byrne H.; Sampaio I.; Farias I.; do Amaral J.V.; Messias M.; da Silva M.N.F.; Trivedi M.; Rossi R.; Hrbek T.; Andriaholinirina N.; Rabarivola C.J.; Zaramody A.; Jolly C.J.; Phillips-Conroy J.; Wilkerson G.; Abee C.; Simmons J.H.; Fernandez-Duque E.; Kanthaswamy S.; Shiferaw F.; Wu D.; Zhou L.; Shao Y.; Zhang G.; Keyyu J.D.; Knauf S.; Le M.D.; Lizano E.; Merker S.; Navarro A.; Bataillon T.; Nadler T.; Khor C.C.; Lee J.; Tan P.; Lim W.K.; Kitchener A.C.; Zinner D.; Gut I.; Melin A.; Guschanski K.; Schierup M.H.; Beck R.M.D.; Umapathy G.; Roos C.; Boubli J.P.; Lek M.; Sunyaev S.; O¿Donnell-Luria A.; Rehm H.L.; Xu J.; Rogers J.; Marques-Bonet T.; Farh K.K.H.. The landscape of tolerated genetic variation in humans and primates. Science 2023; 380(6648). |
|
García-González L, Martí-Sarrias A, Puertas MC, Bayón-Gil Á, Resa-Infante P, Martinez-Picado J, Navarro A, Acosta S.. Understanding the neurological implications of acute and long COVID using brain organoids. DMM Disease Models and Mechanisms 2023; 16(7). |
|
Goodman D.B.; Lind A.L.; Redlich R.W.; Brown A.R.; Teeling E.C.; Andrews G.; Armstrong J.C.; Bianchi M.; Birren B.W.; Bredemeyer K.R.; Breit A.M.; Christmas M.J.; Clawson H.; Damas J.; Di Palma F.; Diekhans M.; Dong M.X.; Eizirik E.; Fan K.; Fanter C.; Foley N.M.; Forsberg-Nilsson K.; Garcia C.J.; Gatesy J.; Gazal S.; Genereux D.P.; Goodman L.; Grimshaw J.; Halsey M.K.; Harris A.J.; Hickey G.; Hiller M.; Hindle A.G.; Hubley R.M.; Hughes G.M.; Johnson J.; Juan D.; Kaplow I.M.; Karlsson E.K.; Keough K.C.; Kirilenko B.; Koepfli K.P.; Korstian J.M.; Kowalczyk A.; Kozyrev S.V.; Lawler A.J.; Lawless C.; Lehmann T.; Levesque D.L.; Lewin H.A.; Li X.; Lind A.; Lindblad-Toh K.; Mackay-Smith A.; Marinescu V.D.; Marques-Bonet T.; Mason V.C.; Meadows J.R.S.; Meyer W.K.; Moore J.E.; Moreira L.R.; Moreno-Santillan D.D.; Morrill K.M.; Muntane G.; Murphy W.J.; Navarro A.; Nweeia M.; Ortmann S.; Osmanski A.; Paten B.; Paulat N.S.; Pfenning A.R.; Phan B.D.N.; Pollard K.S.; Pratt H.E.; Ray D.A.; Reilly S.K.; Rosen J.R.; Ruf I.; Ryan L.; Ryder O.A.; Sabeti P.C.; Schaffer D.E.; Serres A.; Shapiro B.; Smit A.F.A.; Springer M.; Srinivasan C.; Steiner C.; Storer J.M.; Sullivan K.A.M.; Sullivan P.F.; Sundstrom E.; Supple M.A.; Swofford R.; Talbot J.E.; Turner-Maier J.; Valenzuela A.; Wagner F.; Wallerman O.; Wang C.; Wang J.; Weng Z.; Wilder A.P.; Wirthlin M.E.; Xue J.R.; Zhang X.. Evolutionary constraint and innovation across hundreds of placental mammals. Science 2023; 380(6643). |
|
Kirilenko B.M.; Munegowda C.; Osipova E.; Jebb D.; Sharma V.; Blumer M.; Morales A.E.; Ahmed A.W.; Kontopoulos D.G.; Hilgers L.; Hiller M.; Andrews G.; Armstrong J.C.; Bianchi M.; Birren B.W.; Bredemeyer K.R.; Breit A.M.; Christmas M.J.; Clawson H.; Damas J.; Di Palma F.; Diekhans M.; Dong M.X.; Eizirik E.; Fan K.; Fanter C.; Foley N.M.; Forsberg-Nilsson K.; Garcia C.J.; Gatesy J.; Gazal S.; Genereux D.P.; Goodman L.; Grimshaw J.; Halsey M.K.; Harris A.J.; Hickey G.; Hiller M.; Hindle A.G.; Hubley R.M.; Hughes G.M.; Johnson J.; Juan D.; Kaplow I.M.; Karlsson E.K.; Keough K.C.; Kirilenko B.; Koepfli K.P.; Korstian J.M.; Kowalczyk A.; Kozyrev S.V.; Lawler A.J.; Lawless C.; Lehmann T.; Levesque D.L.; Lewin H.A.; Li X.; Lind A.; Lindblad-Toh K.; Mackay-Smith A.; Marinescu V.D.; Marques-Bonet T.; Mason V.C.; Meadows J.R.S.; Meyer W.K.; Moore J.E.; Moreira L.R.; Moreno-Santillan D.D.; Morrill K.M.; Muntane G.; Murphy W.J.; Navarro A.; Nweeia M.; Ortmann S.; Osmanski A.; Paten B.; Paulat N.S.; Pfenning A.R.; Phan B.D.N.; Pollard K.S.; Pratt H.E.; Ray D.A.; Reilly S.K.; Rosen J.R.; Ruf I.; Ryan L.; Ryder O.A.; Sabeti P.C.; Schaffer D.E.; Serres A.; Shapiro B.; Smit A.F.A.; Springer M.; Srinivasan C.; Steiner C.; Storer J.M.; Sullivan K.A.M.; Sullivan P.F.; Sundstrom E.; Supple M.A.; Swofford R.; Talbot J.E.; Teeling E.; Turner-Maier J.; Valenzuela A.; Wagner F.; Wallerman O.; Wang C.; Wang J.; Weng Z.; Wilder A.P.; Wirthlin M.E.; Xue J.R.; Zhang X.. Integrating gene annotation with orthology inference at scale. Science 2023; 380(6643). |
|
Kuderna LFK, Gao H, Janiak MC, Kuhlwilm M, Orkin JD, Bataillon T, Manu S, et al. A global catalog of whole-genome diversity from 233 primate species. Science 2023; 380(6648): 906-13. |
|
Moon K.L.; Huson H.J.; Morrill K.; Wang M.S.; Srikanth K.; Svenson G.J.; Karlsson E.K.; Shapiro B.; Andrews G.; Armstrong J.C.; Bianchi M.; Birren B.W.; Bredemeyer K.R.; Breit A.M.; Christmas M.J.; Clawson H.; Damas J.; Di Palma F.; Diekhans M.; Dong M.X.; Eizirik E.; Fan K.; Fanter C.; Foley N.M.; Forsberg-Nilsson K.; Garcia C.J.; Gatesy J.; Gazal S.; Genereux D.P.; Goodman L.; Grimshaw J.; Halsey M.K.; Harris A.J.; Hickey G.; Hiller M.; Hindle A.G.; Hubley R.M.; Hughes G.M.; Johnson J.; Juan D.; Kaplow I.M.; Karlsson E.K.; Keough K.C.; Kirilenko B.; Koepfli K.P.; Korstian J.M.; Kowalczyk A.; Kozyrev S.V.; Lawler A.J.; Lawless C.; Lehmann T.; Levesque D.L.; Lewin H.A.; Li X.; Lind A.; Lindblad-Toh K.; Mackay-Smith A.; Marinescu V.D.; Marques-Bonet T.; Mason V.C.; Meadows J.R.S.; Meyer W.K.; Moore J.E.; Moreira L.R.; Moreno-Santillan D.D.; Morrill K.M.; Muntane G.; Murphy W.J.; Navarro A.; Nweeia M.; Ortmann S.; Osmanski A.; Paten B.; Paulat N.S.; Pfenning A.R.; Phan B.D.N.; Pollard K.S.; Pratt H.E.; Ray D.A.; Reilly S.K.; Rosen J.R.; Ruf I.; Ryan L.; Ryder O.A.; Sabeti P.C.; Schaffer D.E.; Serres A.; Shapiro B.; Smit A.F.A.; Springer M.; Srinivasan C.; Steiner C.; Storer J.M.; Sullivan K.A.M.; Sullivan P.F.; Sundstrom E.; Supple M.A.; Swofford R.; Talbot J.E.; Teeling E.; Turner-Maier J.; Valenzuela A.; Wagner F.; Wallerman O.; Wang C.; Wang J.; Weng Z.; Wilder A.P.; Wirthlin M.E.; Xue J.R.; Zhang X.. Comparative genomics of Balto, a famous historic dog, captures lost diversity of 1920s sled dogs. Science 2023; 380(6643). |
|
Muntané G., Vázquez-Bourgon J., Sada E., Martorell L., Papiol S., Bosch E., Navarro A., Crespo-Facorro B., Vilella E.. Polygenic risk scores enhance prediction of body mass index increase in individuals with a first episode of psychosis. European Psychiatry 2023. |