Publications
2018
- Jessica Nye, Hafid Laayouni, Martin Kuhlwilm, Mayukh Mondal, Tomas Marques-Bonet, Jaume Bertranpetit “Selection in the Introgressed Regions of the Chimpanzee Genome” Genome biology and evolution 10 (4), 1132-1138
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Carroll R.A.; Ricemeyer E.S.; Hillier L.D.W.; DaCosta J.M.; Osipova E.; Smith S.; Jamie G.A.; Martinez J.G.; Molina-Morales M.; Marques-Bonet T.; Manthey J.D.; Haddad D.; Fuxjager M.J.; Lynch K.S.; Wood J.M.D.; Jarvis E.; Masterson P.; Thibaud-Nissen F.; Hauber M.E.; Spottiswoode C.N.; Sackton T.B.; Balakrishnan C.N.; Sorenson M.D.; Warren W.C.. Genomic resources for comparative analyses of avian obligate brood parasitism. Journal of Heredity 2026; 117(3): 545-556. |
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Mercuri G.; Merici G.; Farh K.K.H.; Kuderna L.F.K.; Rogers J.; Marques-Bonet T.; Donati G.; Percudani R.; Capelli C.. Leaping between branches: hybridisation and the tangled evolutionary history of true lemurs. Molecular Phylogenetics and Evolution 2026; 215: . |
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Stanton D.W.G.; Bergstrom A.; Heintzman P.D.; van der Valk T.; Carmagnini A.; Ersmark E.; Pawar H.; Sandoval-Velasco M.; Androsov S.; Fedorov S.; Kuhlwilm M.; Nagel D.; Plotnikov V.; Protopopov A.; Shapiro B.; Barnett R.; Sinding M.H.S.; Marques-Bonet T.; Yamaguchi N.; Gilbert M.T.P.; Gotherstrom A.; Skoglund P.; Frantz L.; Dalen L.. Paleogenomes reveal the evolutionary relationship between modern and cave lions. Cell 2026; : . |
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Fong-Zazueta R.; Krueger J.; Alba D.M.; Aymerich X.; Beck R.M.D.; Cappellini E.; Carrillo-Martin G.; Cirilli O.; Clark N.; Cornejo O.E.; Farh K.K.H.; Ferrandez-Peral L.; Juan D.; Kelley J.L.; Kuderna L.F.K.; Little J.; Orkin J.D.; Paterson R.S.; Pawar H.; Marques-Bonet T.; Lizano E.. Phylogenetic signal in primate tooth enamel proteins and its relevance for paleoproteomics. Genome Biology and Evolution 2025; 17(2): . |
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Madupe P.P.; Koenig C.; Patramanis I.; Ruther P.L.; Hlazo N.; Mackie M.; Tawane M.; Krueger J.; Taurozzi A.J.; Troche G.; Kibii J.; Pickering R.; Dickinson M.R.; Sahle Y.; Kgotleng D.; Musiba C.; Manthi F.; Bell L.; DuPlessis M.; Gilbert C.; Zipfel B.; Kuderna L.F.K.; Lizano E.; Welker F.; Kyriakidou P.; Cox J.; Mollereau C.; Tokarski C.; Blackburn J.; Ramos-Madrigal J.; Marques-Bonet T.; Penkman K.; Zanolli C.; Schroeder L.; Racimo F.; Olsen J.V.; Ackermann R.R.; Cappellini E.. Enamel proteins reveal biological sex and genetic variability in southern African Paranthropus. Science 2025; 388(6750): 969-973. |
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Melo-Ximenes A.A.d.; Batista R.; Corvalan L.C.J.; Marques-Bonet T.; Kuderna L.; Farh K.; Rogers J.; Kaizer M.d.C.; Boubli J.P.; Melo F.R.d.; Nunes R.; Telles M.P.d.C.. First assembly of a draft genome of the critically endangered northern muriqui (Brachyteles hypoxanthus, primates, atelidae) including non-invasive genotyping strategies for the species. Ecology and Evolution 2025; 15(8): . |
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Orkin J.D.; Kuderna L.F.K.; Hermosilla-Albala N.; Fontsere C.; Aylward M.L.; Janiak M.C.; Andriaholinirina N.; Balaresque P.; Blair M.E.; Fausser J.L.; Gut I.G.; Gut M.; Hahn M.W.; Harris R.A.; Horvath J.E.; Keyser C.; Kitchener A.C.; Le M.D.; Lizano E.; Merker S.; Nadler T.; Perry G.H.; Rabarivola C.J.; Rasmussen L.; Raveendran M.; Roos C.; Wu D.D.; Zaramody A.; Zhang G.; Zinner D.; Pozzi L.; Rogers J.; Farh K.K.H.; Marques Bonet T.. Ecological and anthropogenic effects on the genomic diversity of lemurs in Madagascar. Nature Ecology and Evolution 2025; 9(1): 42-56. |
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Ostridge H.J.; Fontsere C.; Lizano E.; Soto D.C.; Schmidt J.M.; Saxena V.; Alvarez-Estape M.; Barratt C.D.; Gratton P.; Bocksberger G.; Lester J.D.; Dieguez P.; Agbor A.; Angedakin S.; Assumang A.K.; Bailey E.; Barubiyo D.; Bessone M.; Brazzola G.; Chancellor R.; Cohen H.; Coupland C.; Danquah E.; Deschner T.; Dotras L.; Dupain J.; Egbe V.E.; Granjon A.C.; Head J.; Hedwig D.; Hermans V.; Hernandez-Aguilar R.A.; Jeffery K.J.; Jones S.; Junker J.; Kadam P.; Kaiser M.; Kalan A.K.; Kambere M.; Kienast I.; Kujirakwinja D.; Langergraber K.E.; Lapuente J.; Larson B.; Laudisoit A.; Lee K.C.; Llana M.; Maretti G.; Martin R.; Meier A.C.; Morgan D.; Neil E.; Nicholl S.; Nixon S.; Normand E.; Orbell C.; Ormsby L.J.; Orume R.; Pacheco L.; Preece J.; Regnaut S.; Robbins M.M.; Rundus A.; Sanz C.; Sciaky L.; Sommer V.; Stewart F.A.; Tagg N.; Tedonzong L.R.; van Schijndel J.; Vendras E.; Wessling E.G.; Willie J.; Wittig R.M.; Yuh Y.G.; Yurkiw K.; Vigilant L.; Piel A.K.; Boesch C.; Kuhl H.S.; Dennis M.Y.; Marques-Bonet T.; Arandjelovic M.; Andres A.M.. Local genetic adaptation to habitat in wild chimpanzees. Science 2025; 387(6730): . |