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Roderic Guigó ha participado en la secuenciación del genoma del ciempiés

Se ha secuenciado el genoma nuclear del Myriapoda Strigamia marítima, un ciempiés común en las costas del norte de Europa en el marco de un trabajo colaborativo dentro de un consorcio internacional que se ha publicado en PLOSBiology, y que abre un nuevo escenario para mejorar el conocimiento sobre la evolución y la diversificación de los artrópodos Mandibulata.
02.12.2014

 

Se ha secuenciado el genoma nuclear del Myriapoda Strigamia marítima, un ciempiés común en las costas del norte de Europa en el marco de un trabajo colaborativo dentro de un consorcio internacional que se ha publicado en PLOS Biology, y que abre un nuevo escenario para mejorar el conocimiento sobre la evolución y la diversificación de los artrópodos Mandibulata.

strigamia maritima Un consorcio integrado por cincuenta y dos instituciones de investigación de todo el mundo, liderados por los expertos Ariel D. Chipman, David EK Ferrier y Michael Akama, con la participación de Roderic Guigó, catedrático de Genética del Departamento de Ciencias Experimentales y de la Salud (CEXS) de la Universidad Pompeu Fabra (UPF) conjuntamente con Marco Mariotti, miembro de su equipo de investigación en Bioinformática en el Centro de Regulación Genómica (CRG), centro participado y adscrito a la UPF, así como también investigadores de la Universidad de Barcelona.

Una especie atípica como modelo de estudio

S. maritima es el primer Myriapoda del que se ha secuenciado el genoma. Forma parte de uno de los cinco subfilos de los artrópodos, junto con los hexápodos (que incluyen los insectos), los crustáceos, los quelicerados y trilobites (extinguidos). Este organismo, en concreto, es una especie atípica, ya que no tiene ojos y eclosiona del huevo con la dotación completa de segmentos de un adulto. 

S. marítima es la especie modelo de los miriápodos en estudios de ecología y biología del desarrollo ya que su genoma tiene un tamaño reducido (290 megabases), y los ejemplares se pueden capturar con facilidad en la naturaleza y son fáciles de mantener en el laboratorio.

El equipo internacional de expertos ha identificado cerca de 15.000 genes, un número similar al del genoma conocido de muchos insectos. Sin embargo, un 30% de los genes son específicos de  S. marítima, y se habrían originado por varias duplicaciones génicas desde el ancestro común que separa esta especie de otros artrópodos con genoma secuenciado. 

Sin rastro genético de estructuras que captan la luz

Los 15.000 genes identificados -l'espècie humana tiene borde 20.000- están distribuidos en un par de cromosomas grandes y siete pares más pequeños (incluyendo los cromosomas sexuales, X e Y). Según los resultados, la disposición de los genes se encuentra relativamente conservada, ya que es muy parecida a la de los genomas de otros filos animales, y está mucho menos alterada que en el caso de otros organismos modelo en artrópodos como las moscas.

Otro de los resultados más sorprendentes es que no hay ningún indicio en el genoma de  S. marítima sobre estructuras relacionadas con la captación de luz, ni fotorreceptores ni componentes de reloj circadiano.

Referencia del artículo:

Akam, M.; Almeida, F. C.; Chipman, A. D.; Ferrier, D. E. K.; Rozas, J.; Sánchez Gracia, A., et al.  «The first myriapod genome sequence reveals conservative arthropod gene content and genome organisation in the centipede  Strigamia maritima» PLOS Biology, novembre de 2014. DOI: 10.1371/journal.pbio.1002005

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