• Grup de Recerca d'Història de la Ciència i Cultura Moderna. Coordinació: Daniele Cozzoli
• Grup d'Estudis de les Institucions i Societat a la Catalunya Moderna. Coordinació: Joaquim Albareda Salvadó
• Grup de Recerca en Estats, Nacions i Sobiranies (GRENS). Coordinació: Josep Pich Mitjana
• Grupo de Recerca en Cultura, Arqueologia i Dinàmiques Socioecològiques (CASEs). Coordinació: Marco Madella
• Grup de Recerca en Etnografia, contactes culturals i missions als Imperis Ibèrics -segles XVII-XVIII (ECERM). Coordinació: Joan Pau Rubiés Mirabet.
• Grup de Recerca en Imperis, Metròpolis i Societats Extraeuropees (GRIMSE). Coordinació: Martín Rodrigo y Alharilla
• Grup de Recerca en Nexes entre Ciència, Cultura, Política, Religió i Societat (NEXES). Coordinació: Albert Presas Puig
• Grup de Recerca en Geohumanitats. Coordinació: Rosa Cerarols Ramírez
• Grup de Recerca del Laboratori d'Arqueologia. Coordinació: M. Eugenia Aubet

Unitat de Recerca en Arqueologia Social i Estudis de Gènere (GRASEG)

• Grup de Recerca d'Arqueologia Mediterrània: Connexions, Materialitats i Escriptura (GRACME). Coordinació: Ana Delgado Hervás
• Grup de Recerca en Colonialisme, Gènere i Materialitats (CGyM). Coordinació del grup i de la unitat: Sandra Monton Subías