Notícies Notícies

Torna a la pàgina principal
Vés enrere

Una nova versió de DisGeNET inclou un recurs per la COVID-19

Una nova versió de DisGeNET inclou un recurs per la COVID-19

DisGeNET és una plataforma pública de gestió del coneixement que ofereix informació sobre gens i variants genòmiques associades a malalties humanes.

27.05.2020

Imatge inicial

El grup d'Informàtica Biomèdica Integrada del GRIB (IMIM-UPF) ha llançat una nova versió de DisGeNET (versió 7.0), que conté més d'1 milió d'associacions entre 21.000 gens  i 30.000 malalties, i 350.000 associacions que involucren més de 190.000 variants genòmiques. S'han actualitzat totes les fonts de dades, inclosa la informació extreta automàticament de la literatura mitjançant tècniques de mineria de textos. Així mateix s'ha creat un nou recurs enfocat a la COVID-19.

DisGeNET és una plataforma pública de gestió del coneixement que ofereix informació sobre gens i variants genòmiques associades a malalties humanes, obtinguda a partir de la integració de més d'una dotzena de recursos públics i de la literatura científica. Conté una de les col·leccions més completes actualment disponibles de gens i variants associades a malalties humanes.

Han personalitzat el software de mineria de textos usat a DisGeNET per analitzar la literatura i identificar mencions de COVID-19, el virus SARS-CoV-2 i altres malalties i símptomes concomitants.

Les novetats de la versió actual inclouen noves dades per a variants genòmiques i una nova funcionalitat de cerca de malalties, que permet ampliar la cerca de les mateixes amb nous conceptes basats en similituds semàntiques.

Així mateix, com a part dels esforços de la comunitat per estructurar els nous coneixements emergents sobre la pandèmia COVID-19, el grup ha desenvolupat un recurs sobre COVID-19 basat en tècniques de mineria de textos, utilitzada per extreure informació de la literatura científica.

Aquest recurs pot donar suport a la investigació de factors de risc rellevants per a la pandèmia, així com de la varietat de símptomes observats en diferents poblacions o l'aparició de malalties concomitants.

Des del brot de l'epidèmia, el nombre de publicacions sobre COVID-19 augmenta diàriament. El grup ha personalitzat el software de mineria de textos usat a DisGeNET per analitzar la literatura i identificar mencions de COVID-19, el virus SARS-CoV-2 i altres malalties i símptomes concomitants. Aquesta informació s'actualitza regularment i està disponible públicament.

Aquest recurs pot donar suport a la investigació de factors de risc rellevants per a la pandèmia, així com de la varietat de símptomes observats en diferents poblacions o l'aparició de malalties concomitants.

Aquests desenvolupaments son possibles gràcies al suport de l'empresa MedBioinformatics Solutions, la spin-off de la UPF i l’IMIM que va néixer el passat 6 de febrer.

Multimèdia

Multimedia

Multimedia

Categories:

Per a més informació

Para más información

For more information

Notícia publicada per:

Noticia publicada por:

News published by:

Unitat de Comunicació i Projecció Institucionals

Unidad de Comunicación y Proyección Institucionales

Institutional Communication and Promotion Unit