Los artículos publicados por los investigadores de la Universidad Pompeu Fabra son los que presentan un número medio de citas por artículo más alto (13,5 citas por artículo) de las 71 universidades del estado español, según se desprende del estudio "Informe anual 2006 sobre la visibilidad de la Universidad Rovira i Virgili", que, elaborado por dicha universidad basándose en los datos del Institute for Scientific Information (ISI), señala la calidad de las publicaciones de la UPF.
Este mismo trabajo pone de manifiesto que la UPF también lidera el ranking de universidades españolas según el número de publicaciones científicas (383) por profesor funcionario (289), que se traduce en una ratio de 1,33 publicaciones por profesor.