La última semana de febrero se llevó a cabo, con un notable éxito de asistencia y cumplimiento de objetivos, la primera Barcelona School on Biomedical Informatics, promovida desde la Unitat de Recerca en Informàtica Biomèdica (GRIB) y organizada en colaboración con los proyectos europeos del 6º programa marco BioBridge y Q osCosGrid y con la red de excelencia del séptimo programa marco Virtual Physiological Human (VPH), así como el Instituto Nacional de Bioinformática (INB).

Jordi Villà i Freixa, profesor del Departamento de Ciencias Experimentales y de la Salud (CEXS) de la UPF y coordinador del màster oficial en Bioinformática para las Ciencias de la Salud de la UPF, fue el responsable de esta actividad que contó con la participación de 35 alumnos de postgrado, 16 de los cuales provinieron de la UPF y 19 de otras instituciones académicas.

La escuela consistió en una innovadora fórmula que combinó la presencia de trece ponentes expertos en el campo de la bioinformática, que condujeron conferencias plenarias y tutoriales, seguido de sesiones de trabajo en grupos dónde los alumnos aplicaron algunos de los conocimientos adquiridos durante las sesiones matinales y aplicaron a ejemplos de interés biomédico.

En el transcurso de la actividad se plantearon tres casos ejemplares. Concretamente, sobre isquemia y reperfusión coronaria en cardiomiocitos; EPOC y fibrosis quística, respectivamente. Los alumnos, aportaron la propia experiencia en campos de búsqueda tan distantes como las matemáticas o la computación, y la medicina por tal de proponer posibles protocolos integrados de uso de herramientas bioinformáticas en la solución de estos problemas médicos tan relevantes.

La Escuela se ha basado en dos proyectos de búsqueda prioritarios para la Unión Europea

En esta primera edición, la Escuela ha empleado en las herramientas computacionales desarrolladas por dos proyectos STREP (Specific Targeted Research Projects) del VI Programa Marco de los cuales la UPF forma parte:  QosCosGrid y BioBridge. 

El proyecto BioBridge tiene como objetivo principal desarrollar herramientas de software capaces de integrar los conocimientos específicos provenientes de la genómica, la proteómica y la metabolómica mediante herramientas provenientes de la biología de sistemas por tal de construir un nexo de unión entre la práctica clínica y las ciencias básicas experimentales.

El proyecto QosCosGrid (acrónimo de Quasi Opportunistic Supercomputing for Complex Systems Simulations in Grid Environments) es una plataforma computacional que busca optimizar como las simulaciones de sistemas complejas se pueden realizar en entornos de cálculo grid altamente distribuidos, acercándose al paradigma de computación en superordenadores y con un coste mucho menor.