L'avaluació dels aprenentatges dels estudiants és un tema totalment prioritari de la FCSV, ja que sabem que el tipus d'avaluació dirigeix l'aprenentatge dels estudiants. Així, des dels seus inicis, el centre es va dotar d'un projecte col·lectiu d'avaluació que permet una avaluació fiable i vàlida amb la màxima informació per als estudiants . L'estudiant té a la seva disposició, dins dels plans docents de les assignatures, una informació detallada sobre l'avaluació de cadascuna de les assignatures (http://www.upf.edu/biomed/llicenciatura/programes.html).
Durant els estudis de la llicenciatura en Biologia, i també durant l'experiència pilot, s'han establert les equivalències d'assignatures per convalidar dins dels programes oficials de mobilitat (http://www.upf.edu/biomed/llicenciatura/normativa.html). En els casos d'activitats no corresponents a assignatures concretes, el reconeixement ha estat en crèdits de lliure configuració.
Els estudis de Biologia de la UPF, també els estudiants objecte de l'experiència pilot, tenen un últim curs totalment professionalitzador, ja que inclou sis mesos de pràctiques professionals reals amb un valor de 20 crèdits. L'avaluació d'aquestes pràctiques es fa mitjançant un informe del tutor; una memòria de pràctiques, equivalent al futur treball de fi de carrera, i una presentació del treball en format pòster en una jornada de graduació en què participen els futurs graduats, el professorat i el PAS de la Facultat.